原子力顯微鏡的懸臂大小在數(shù)十至數(shù)百微米，通常由硅或者氮化硅構(gòu)成，其上裝有探針，探針尖的曲率半徑在納米量級。當(dāng)探針被放置到樣品表面附近時，懸臂上的探針頭會因受到樣品表面的范德瓦耳斯力而彎曲偏移。偏移由射在微懸臂上的激光束反射至光敏二極管陣列而測量到，較薄的懸臂表面常鍍有反光材質(zhì)以增強反射。
 

　　原子力顯微鏡在植物研究中也有應(yīng)用，植物細(xì)胞中含有成百上千種蛋白質(zhì)，占細(xì)胞干重的比例僅次于纖維素，是植物細(xì)胞的重要組成部分。蛋白質(zhì)通過結(jié)構(gòu)的改變-構(gòu)象的變化來行使功能，人們采用很多手段分析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能。而原子力顯微鏡在蛋白質(zhì)研究中的應(yīng)用成為電子顯微鏡、X射線結(jié)晶學(xué)和核磁共振技術(shù)的有力補充。膜蛋白的晶體結(jié)構(gòu)解析是國際難題，而光合作用相關(guān)蛋白歷來是植物學(xué)家們關(guān)注的焦點。
 

　　原子力顯微鏡作為一種表面檢測工具，可實現(xiàn)眾多目標(biāo)。目前的研究主要集中在光合作用蛋白和細(xì)胞壁等幾個方面，僅發(fā)揮著“眼”的作用，“手”的功能還沒有體現(xiàn)。更為深入的研究才剛剛起步，亟待解決的問題是對各種實驗方法進(jìn)行不斷的改進(jìn)和創(chuàng)新。隨著科技的進(jìn)步，原子力顯微鏡將與其它顯微技術(shù)及生物技術(shù)有機地結(jié)合起來，其應(yīng)用前景會更為廣闊，并在植物學(xué)研究中發(fā)揮更大的作用。